Epigenetics and beyond: targeting writers of protein lysine

Epigenetics and beyond: targeting writers of protein lysine

晓暮
1年前发布
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Bhat et al. - 2021 - Epigenetics and beyond targeting writers of protein lysine methylation to treat disease.pdf

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文章总结

  • 引言

    • 蛋白质赖氨酸甲基化是一种重要的翻译后修饰,其调节着组蛋白和非组蛋白的功能,赖氨酸甲基转移酶(KMTs)的失调与许多疾病有关,包括癌症、精神健康障碍和发育障碍等。
    • 2020年,tazemetostat成为首个获FDA批准的KMT抑制剂,用于治疗上皮样肉瘤和滤泡性淋巴瘤,还有更多抑制剂正在临床和临床前评估中。
  • writers of lysine methylation(赖氨酸甲基化的写入者)

    • 两类具有KMT活性的蛋白质域家族:SET域(约60%的含SET域蛋白具有明确的甲基化活性)和7βS域(DOT1L和KMT9催化组蛋白赖氨酸甲基化,其他一些酶甲基化细胞质蛋白)。
    • 临床相关的组蛋白甲基化位点:H3K4、H3K9、H3K27、H3K36、H3K79、H4K20和H4K12等。
    • 治疗靶点的基本原理:KMTs表面至少有两个可用于化学靶向的不同口袋,即甲基供体S - 腺苷甲硫氨酸(SAM)的辅因子结合位点和赖氨酸底物结合口袋,大多数KMTs具有高度的底物特异性,且一些与癌症相关的KMTs存在染色体易位、增益功能突变和基因扩增等情况,有利于药物开发和患者选择。
    • 开发KMT抑制剂的一般化学考虑和策略:许多现有的KMT抑制剂是底物竞争者,SAM - 竞争性抑制剂的主要问题不是选择性,而是亲水性差,可能导致细胞渗透性差,但已开发出具有良好细胞渗透性的SAM - 竞争性临床级抑制剂;结构信息有助于理解酶的选择性,从而推动新临床候选抑制剂的发现。
  • EZH2抑制剂

    • EZH2的生物学特性和临床背景:EZH2是Polycomb抑制复合物2(PRC2)的主要催化亚基,催化H3K27甲基化以抑制基因转录;EZH2在多种癌症中过表达,其突变与淋巴瘤等疾病相关;此外,一些癌症类型依赖于升高的H3K27me3水平,对EZH2抑制剂敏感。
    • 化学和结构考虑:多种强效和选择性的PRC2 - EZH2抑制剂被报道,如tazemetostat、GSK126、CPI - 1205和PF - 06821497等,它们大多含有吡啶酮核心,是SAM - 竞争性抑制剂;药物开发受益于结构信息,如PRC2与底物和抑制剂的复合物结构揭示了EZH2与其他亚基的相互作用以及抑制剂的作用机制。
    • 临床结果:tazemetostat已获FDA批准用于治疗上皮样肉瘤和滤泡性淋巴瘤,其他EZH2抑制剂在临床试验中也显示出一定的疗效,但仍需进一步研究以确定最佳的治疗方案和患者群体。
    • 替代治疗策略:靶向PRC2的其他功能重要且可成药的组件,如干扰EED与H3K27me3的相互作用或阻断DOT1L与其结合伴侣的相互作用,可能是一种可行的临床治疗策略。
    • 未来应用和挑战:EZH2在癌症发病机制中具有两面性,在不同癌症类型中作用不同,且其对肿瘤免疫逃避和免疫治疗耐药性的影响复杂,需要仔细的患者分层;未来EZH2抑制剂的应用可能扩展到血液和实体肿瘤,且新一代抑制剂可能有助于与其他治疗方法的联合应用。
  • DOT1L抑制剂

    • DOT1L的生物学特性:DOT1L是唯一已知的催化H3K79甲基化的酶,该修饰与转录激活相关,DOT1L在胚胎发育、造血和心血管系统中至关重要,其失调驱动一部分儿童白血病。
    • 临床背景:DOT1L活动和H3K79二甲基化是某些血液恶性肿瘤(如MLL - r白血病)发生的重要驱动因素,MLL基因融合导致DOT1L的异常定位和H3K79甲基化增加,从而促进肿瘤发生。
    • 化学和结构考虑:EPZ004777和pinometostat等抑制剂基于DOT1L的辅因子产物SAH和酶活性位点的晶体结构设计,具有高 potency和选择性,与DOT1L的相互作用涉及特定的结构特征和口袋形成。
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